تدور أحداث فيلم الإبرة حول زوجين تونسيين شابين تنقلب حياتهما رأساً على عقب بعد ولادة طفلهما، ليكتشفا أنه وُلد بخصائص جنسية مزدوجة.

وأمام هذا الوضع الحساس، يجد الزوجان نفسيهما أمام قرار مصيري ومعقد، إذ لا يملكان سوى ثلاثة أيام فقط لحسم مستقبل طفلهما وتحديد جنسه، وسط ضغوط اجتماعية ونفسية وطبية متزايدة.