تدور أحداث مسلسل مدرسة ثانوية سرية - Undercover High School في إطار درامي مشوق حول عميل المخابرات الوطنية المحترف جونغ هاي سونغ، الذي خفضت رتبته بعد فشل مهمته، يتخفى في مدرسة ثانوية للعثور على ذهب الملك غوجونغ المفقود، ويلتقي بمعلمته أوه سو آه، التي تعتبره حبها الأول المفقود، مما يُثير حزنها القديم، والتي تحلم بأن تُصبح عضوًا مُدرّسًا مُتفرّغًا، مع تقاربهما، يكشف هاي سونغ الفسادَ المُظلمَ في المدرسة، وبمساعدة آخرين، يبدأ مُكافحة القوى المُتنفّذة.