يتابع الفيلم الأحداث المثيرة التي بدأت في الجزء السابق؛ حيث يخوض العميل إيثان هانت وفريقه في منظمة الـ IMF أخطر مهمة لهم على الإطلاق. تتمحور القصة حول مطاردة الذكاء الاصطناعي الغامض والمخيف المعروف باسم "الكيان" وتحييده قبل أن تقع سيطرته في الأيدي الخطأ. يبحث إيثان عن شيفرة المصدر والغواصة الروسية الغارقة "سيفاستوبول" التي تحتوي على مفتاح السيطرة على هذا الكيان، في الوقت الذي تلاحقه فيه الحكومات من جهة، وشبح من ماضيه يُدعى "غابرييل" من جهة أخرى,